Visualization and data exploration of chromosome conformation capture data using Voronoi diagrams with v3c-viz

Visualization and data exploration of chromosome conformation capture data using Voronoi diagrams with v3c-viz

Chromosome conformation capture (3C) sequencing approaches, like Hi-C or micro-C, allow for an unbiased view of chromatin interactions. Most analysis methods rely on so-called interaction matrices, which are derived from counting read pairs in bins of fixed size. Here, we propose the Voronoi diagr...

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Bibliographische Detailangaben
Autoren: Race, Alan M., Fuchs, Alisa, Chung, Ho-Ryun
Format: Artikel
Sprache:Englisch
Veröffentlicht: Philipps-Universität Marburg 2024
Schlagworte:
Chromatin analysis
Software
Bioinformatics
Medizin
Medical sciences Medicine
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Signatur: urn:nbn:de:hebis:04-es2024-08845
Publikationsdatum: 2024-04-23
Quelle: Erstveröffentlichung: Race, A.M., Fuchs, A. & Chung, HR. Visualization and data exploration of chromosome conformation capture data using Voronoi diagrams with v3c-viz. Sci Rep 13, 22020 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-49179-x
Downloads: 19 (2024)
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Zugangs-URL: https://archiv.ub.uni-marburg.de/es/2024/0884
https://doi.org/10.1038/s41598-023-49179-x

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