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Titel:Molekularbiologische und biochemische Untersuchungen zu 2-Oxoglutarat abhängigen Dioxygenasen in Equisetum arvense L. und Petroselinum crispum (Mill.) Nyman & A.W. Hill
Autor:Bredebach, Miriam
Weitere Beteiligte: Matern, Ulrich (Prof. Dr. Dr. h.c. )
Veröffentlicht:2013
URI:https://archiv.ub.uni-marburg.de/diss/z2013/0081
DOI: https://doi.org/10.17192/z2013.0081
URN: urn:nbn:de:hebis:04-z2013-00811
DDC: Naturwissenschaften
Titel (trans.):Molecular biological and biochemical investigation of 2-oxoglutarate dependent dioxygenases in Equisetum arvense L. and Petroselinum crispum (Mill.) Nyman & A.W. Hill
Publikationsdatum:2013-03-12
Lizenz:https://rightsstatements.org/vocab/InC-NC/1.0/

Dokument

Schlagwörter:
Ackerschachtelhalm, flavonoids, Petersilie, FNS, dioxygenases, Dioxygenasen, Flavonoide, horsetail, FLS, Flavonoidstoffwechsel, FHT, parsley, Schachtelhalm

Zusammenfassung:
In der vorgelegten Arbeit wurden 2-Oxoglutarat-abhängige Dioxygenasen aus dem Flavonoidstoffwechsel - unter besonderer Berücksichtigung der FNS I, FLS und ANS - von Equisetum arvense und Petroselinum crispum untersucht. E. arvense ist einer phylogenetisch sehr alten Gattung zuzuordnen und enthält eine große Zahl unterschiedlicher Flavonoide, die bereits gut erforscht sind (Saleh et al., 1971, Veit et al., 1995). Der Flavonoidstoffwechselweg in der Pflanze ist jedoch noch ungeklärt. In der hier vorgelegten Arbeit konnten im Enzymrohextrakt verschiedene 2-ODD-Aktivitäten nachgewiesen werden. Neben einer FHT- und FLS-Reaktion wurde zweifelsfrei auch eine FNS I-Aktivität bestimmt und konnte in Ansätzen charakterisiert werden. Dies ist ein erster Beweis, dass die Bildung von Flavonen mittels 2-ODD nicht allein auf die Familie der Apiaceae beschränkt ist. Der Versuch allerdings, die verantwortlichen Enzyme durch Proteinreinigung zu isolieren und funktionell zu charakterisieren, scheiterte aber an der Instabilität der Proteine. Ebenso konnte die schnell abnehmende katalytische Aktivität auch mit spezifischer Affinitätschromatographie nicht angereichert werden. Dahingegen konnten zwei 2-ODDn-cDNA-Sequenzen erfolgreich kloniert und exprimiert werden. Hierbei wurden Klonierungen mittels RT-PCR und cDNA-Bank-Screening durchgeführt. Da die exprimierten Proteine funktionell nicht mit den angebotenen Substraten identifiziert werden konnten, konnten diese evolutionär nicht verglichen werden. Auch mit Hilfe der phylogenetischen Analyse und aufgrund einer niedrigen Identität von 30 % zu anderen 2-ODDn konnte keine Aussage über die enzymatische Funktion getroffen werden. Die strukturelle Analyse der Polypeptid-Sequenzen und der genomischen Strukturen weist widersprüchliche Ergebnisse auf. Auf diese Weise kann nicht eindeutig geklärt werden, ob es sich bei den exprimierten cDNA-Sequenzen um 2-ODDn aus dem Flavonoidstoffwechsels handelt. Es ist dennoch wahrscheinlich, dass die klonierten Sequenzen für 2-ODDn kodieren. Der zweite Untersuchungsgegenstand war die Flavonoidbiosynthese der Petersilie, bei der durch Trockenstress die Bildung roter Farbstoffe im Stängel erreicht werden konnte. Diese konnten als Anthocyane identifiziert werden, die ausschließlich in gestressten Pflanzen zu finden waren und als Glykoside der Aglyka Cyanidin und Peonidin identifiziert werden konnten. Als verantwortliches Enzym der Anthocyanidin-Synthese, konnte die ANS aus P. crispum mittels RT-PCR und RACE-Technik erfolgreich kloniert und exprimiert werden. In Biotransformationen mit Bakterienkulturen konnte die für ANS bereits mehrfach nachgewiesene Nebenreaktion von Dihydroflavonolen zu Flavonolen (Welford et al., 2001; Turnbull et al., 2004) bestätigt werden. Die Hauptreaktion von Leukoanthocyanidinen zu Anthocyanidinen konnte jedoch weder in in vitro Enzymtests noch in Biotransformationen nachgewiesen werden. Zur Abgrenzung von ANS-Sequenzen gegenüber FLS-Sequenzen wurde auf molekulargenetischer Ebene die genetische Information weiter untersucht und es wurden verschiedene Polypeptid-Strukturanalysen durchgeführt. Sowohl Alignments der Polypeptid-Sequenzen von PcFLS und AtANS, die Phylogenie-Analyse als auch die Untersuchung des genomischen Klons und Analyse der Intronlage bestätigten das Vorliegen einer ANS. Weiter konnte mit Hilfe der semiquantitativen PCR gezeigt werden, dass Transkripte, die zunächst in ungestresst kultivierter Petersilie nachweisbar waren, in Petersilie, die unter Trockenstress kultiviert worden war, abnahmen oder sogar nicht mehr detektiert werden konnten. Lediglich das für die ANS kodierende Transkript konnte gleichbleibend detektiert werden, während das Transkript des DFR-Gens erst unter Trockenstress nachweisbar wurde. Dies bestätigte die de novo Synthese der Anthocyane auf Expressionsebene, die bereits durch die Inhaltsstoffanalytik angenommen worden war.

Bibliographie / References

  1. Yan, Y., Li, Z., Koffas, M.A.G., 2008. High-Yield Anthocyanin biosynthesis in engineered Escherichia coli. Biotechnol. Bioeng. 100, 126-140
  2. Sutter, A., Poulton, J., Grisebach, H., 1975. Oxidation of flavanones to flavone with cell-free extracts from young parsley leaves. Arch. Biochem. Biophys. 170, 547-556 IX. Referenzen 156
  3. Wellmann, E., 1974. UV dose-dependent induction of enzymes related to flavonoid biosynthesis in cell suspension cultures of parley. FEBS Lett. 51, 105-107
  4. Smith, J.J., John, P., 1993. Activation of 1-Aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase by bicarbonate/carbon dioxide. Phytochemistry 32, 1381-1386
  5. Veit, M., Beckert, C., Höhne, C., Bauer, K., Geiger, H., 1995. Interspecific and intraspecific variation of phenolics in the genus Equisetum subgenus Equisetum. Phytochemistry 38, 881-891
  6. Zhang, Z., Ran, J.-S., Clifton, I.J., Schofield, C.J., 2004. Crystal structure and mechanistic implications of 1-Aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase – the ethylene-forming enzyme. Chem. Biol. 11, 1383-1394 X. Anhang Lebenslauf Name: Bredebach, geb. Hundt Vorname: Miriam Geburtsdatum: 01.05.1982
  7. Preuss, A., Stracke, R., Weisshaar, B., Hillebrecht, A., Matern, U., Martens, S., 2009. Arabidopsis thaliana expresses a second functional flavonol synthase. FEBS Lett. 583, 1981-1986
  8. McNulty, J., Nair, J.J., Bollareddy, E., Keskar, K., Thorat, A., Crankshaw, D.J., Holloway, A.C., Khan, G., Wright, G.D., Ejim, L., 2009. Isolation of flavonoids from the heartwood and resin of Prunus avium and some preliminary biological investigations. Phytochemistry 70, 2040-2046
  9. Plaper, A., Golob, M., Hafner, I., Oblak, M., Solmajer, T., Jerala, R., 2003. Characterization of quercetin binding site on DNA gyrase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306, 530-536
  10. Skaltsa, H., Verykokidou. E., Harvala, C., Karabourniotis, G., Manetas, Y., 1994. UV-B protective potential and flavonoid content of leaf hairs in Quercus ilex. Phytochemistry 37, 987-990
  11. Ryan, K.G., Swinny, E.E., Markham, K.R., Winefield, C., 2002. Flavonoid gene expression and UV photoprotection in transgenic and mutant Petunia leaves. Phytochemistry 59, 23-32
  12. Schofield, C.J., Zhang, Z., 1999. Structural and mechanistic studies on 2-oxoglutarate-dependent oxygenases and related enzymes. Curr. Opin. Struc. Biol. 9, 722-731
  13. Turnbull, J.J., Nagle, M.J., Seibel, J.F., Welford, R.W.D., Grant, G.H., Schofield, C.J., 2003. The C-4 sterochemistry of leucocyanidin substrates for anthocyanidin synthase affects product selectivity. Bioorg. Med. Chem. Lett. 13, 3853-3857
  14. Sim, J., Wong, E., Chin, H.S., Sim, T.S., 2003. Conserved structural modules and bonding networks in isopenicillin N synthase related non-haem iron-dependent oxygenases and oxidases. J. Mol. Catal. B. Enzym 23, 17-27
  15. Waser, N.M., Price, M.V., 1983. Pollinator behavior and natural selection for flower colour in Delphinium nelsonii. Nature 302, 422-424
  16. Zhang, Z., Schofield, C.J., Baldwin, J.E., Thomas, P., John, P., 1995. Expression, purification and characterization of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase from tomato in Escherichia coli. Biochem. J. 307, 77-85
  17. Wellmann, F., Lukačin, R., Moriguchi, T., Britsch, L., Schiltz, E., Matern, U., 2002. Functional expression and mutational analysis of flavonol synthase from Citrus unshiu. Eur. J. Biochem. 269, 4134-4142 IX. Referenzen 157
  18. Mori, K., Goto-Yamamoto, N., Kitayama, M., Hashizume, K., 2007. Loss of anthocyanins in red-wine grape under high temperature. J. Exp. Bot. 58, 1935-1945
  19. Mutasa-Göttgens, E., Hedden, P., 2009. Gibberellin as a factor in floral regulatory networks. J. Exp. Bot. 60, 1979-1989
  20. Tamura, K., Dudley, J., Nei, M., Kumar, S., 2007. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Mol. Biol. Evol. 24, 1596-1599
  21. Stafford, H.A., 1991. Flavonoid evolution: an enzymic approach. Plant Physiol. 96, 680-685
  22. Shang, Y., Venail, J., Mackay, S., Bailey, P.C., Schwinn, K.E., Jameson, P.E., Martin, C.R., Davies, K.M., 2011. The molecular basis for venation patterning of pigmentation and its effect on pollinator attraction in flowers of Antirrhinum. New Phytologist 189, 602-615
  23. Yan, Y., Chemler, J., Huang, L., Martens, S., Koffas, M.A., 2005. Metabolic engineering of anthocyanin biosynthesis in Escherichia coli. Appl. Environ. Microbiol. 71, 3617-3623
  24. Ryan, K.G., Swinny, E.E., Winefield, C., Markham, K.R., 2001. Flavonoid and UV photoprotection in Arabidopsis mutants. Z. Naturforsch. 56c, 745-754
  25. Rohde, B., 2008. Acridonbiosynthese in Ruta graveolens L.: Molekularbiologie und Biochemie der Anthranilat N-Methyltransferase. Dissertation Philipps-Universität Marburg
  26. Miksch, M., Boland, W., 1996. Airborne methyl jasmonate stimulates the biosynthesis of furanocoumarins in the leaves of celery plant (Apium graveolens). Experientia 52, 739-743
  27. Miura, H., Kitamura, Y., Ikenaga, T., Mizobe, K., Shimizu, T., Nakamura, M., Kato, Y., Yamada, T., Maitani, T., Goda, Y., 1998. Anthocyanin production of Glehnia littoralis callus cultures. Phytochemistry 48, 279-283
  28. Mikanagil, Y., Saito, N., Yokoi, M., Tatsuzawa, F., 2000. Anthocyanins in flowers of genus Rosa, sections Cinnamomeae, Chinenses, Gallicanae and some modern garden roses. Biochem. Syst. Ecol. 28, 887-902
  29. Martínez, A.E., Favret, E.A., 1990. Anthocyanin synthesis and lengthening in the first leaf of barley isogenic lines. Plant Sci. 71, 35-43
  30. Van der Meer, I.M., Stam, M., van Tunen, A.J., Mol, J.N.M., Stuitje, A.R., 1992. Antisense inhibition of flavonoid biosynthesis in Petunia anthers results in male sterility. Plant Cell 4, 253-262
  31. Wagner, H.; Bauer, R., 1999. Arzneidrogen und ihre Inhaltsstoffe – 6., neu bearb. und erw. Aufl. Stuttgart: Wiss. Verl.-Ges.
  32. Mo, Y., Nagel, C., Taylor, L.P., 1992. Biochemical complementation of chalcon synthase mutants defines a role for flavonols in functional pollen. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 89, 7213-7217
  33. Myllyharju, J., Kivirikko, K.I., 1997. Characterization of the iron-and 2-oxoglutaratebinding sites of human prolyl 4-hydroxylase. EMBO J. 16, 1173-1180
  34. Sharp, P.M., Cowe, E., Higgins, D.G., Schields, D.C., Wolfe, K.H., Wright, F., 1988. Codon usage patterns in Escherichia coli, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae Schizosaccaromyces pombe, Drosophila melanogaster and Homo sapiens; a review of the considerable within species diversity. Nucleic Acids Res. 16, 8207-8211
  35. Wolf, E. 2007. Den Tag mit Phytos besser durchstehen. Pharm. Z.: http://www.pharmazeutische- zeitung.de/index.php?id=3638
  36. Geburtsort: Olpe Staatsangehörigkeit: Deutsch Familienstand: Verheiratet Ehemann: Patrick Bredebach geb. am 18.02.1982 wissenschaftl. Angestellter der Universität Siegen Abitur: 2001, St. Franziskus-Gymnasium Olpe Studium: Studium der Pharmazie an der Philipps-Universität Marburg/Lahn von Oktober 2001 bis September 2005
  37. Ross, J.A., Kasum, C.M., 2002. Dietary Flavonoids: Bioavailability, Metabolic Effect and Safety. Annu. Rev. Nutr. 22, 19-34
  38. Prescott, A.G., John, P., 1996. Dioxygenases: Molecular structure and role in plant metabolism. Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 47, 245-271
  39. Saito, K., Kobayashi, M., Zhizhong, G., Yohikazu, T., Yamazaki, M., 1999. Direct evidence for anthocyanidin synthase as a 2-oxoglutarate dependent oxygenase: molecular cloning and functional expression of cDNA from a red forma of Perilla frutescens. Plant J. 17, 181-189
  40. Staniszewka, I., Królicka, A., Malinski, E., Lojkowska, E., Szafranek, J., 2003. Elicitation of secondary metabolites in in vitro cultures of Ammi majus L. Enzym Microb. Tech. 33, 565-658
  41. Ubi, B.E., 2004. External stimulation of anthocyanin biosynthesis in apple fruit. JFAE 2, 65-70
  42. Wollenweber E. 1982. Flavones and flavonols. In: Harborne JB, Mabry TJ, eds. The flavonoids: advances in research. London: Chapman and Hall, 189–259
  43. Myhrstad, M.C., Carlsen, H., Nordstrom, O., Blomhoff, R., Moskaug, J.O., 2002. Flavonoids increase the intracellular glutathione level by transactivation of the gamma-glutamylcysteine synthetase catalytical subunit promoter. Free Radic. Biol. Med. 32, 386-393
  44. Saleh, N.A.M., Majak, W., Towers, G.H.N., 1972. Flavonoids of Equisetum species. Phytochemistry 11, 1095-1099
  45. Schulze-Lefert, P., Becker-Andre, M., Schulz, W., Hahlbrock, K., Dangl, J.L., 1989. Functional architecture of the light-responsive chalconesynthase promoter from parsley. Plant Cell 1, 707-714
  46. Szabo, E., Thelen, A., Petersen, M., 1999. Fungal elicitor preparations and methyl jamonate enhance rosmarinic acid accumulation in suspendion cultures of Coleus blumei. Plant Cell Rep. 18, 485-489
  47. Smith, J.J., Zhang, Z.H., Schofield, C.J., John, P., Baldwin, J.E., 1994. Inactivation of 1- aminocyclopropane-i-carboxylate (ACC) oxidase. J. Exp. Bot. 45, 521-527
  48. Welle, R., Schröder, G., Schiltz, E., Grisebach, H., Schröder, J., 1991. Induced plant responses to pathogen attack – Analysis and heterologous expression of the key enzyme in the biosynthesis of phytoalexins in soybean (Glycine max L. Merr. cv. Harosoy 63). Eur. J. Biochem. 196, 423-430
  49. Nagao, A., Seki, M., Kobayashi, H., 1999. Inhibition of xanthine oxidase by flavonoids. Biosci. Biotechnol. Biochem. 63, 1787-1790
  50. Schmelzer, E., Jahnen, W., Hahlbrock, K., 1988. In situ localization of light-induced chalcon synthase mRNA, chalcone synthase and flavonoid endproducts in epidermal cells of parsley leaves. Proc. Nat.
  51. Wisman, E., Harmann, U., Sagasser, M., Baumann, E., Palme, K., Hahlbrock, K., Saedler, H., Weisshaar, B., 1998. Knock-Out mutants from an En-1 mutagenized Arabidopsis thaliana population generate phenylpropanoid biosynthesis phenotypes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 12432-12437
  52. Schlicher, H., Kammerer, S., Wegener, T., 2007. Leitfaden Phytotherapie, 3. Auflage. Elsevier GmbH München
  53. Stevenson, P.C., Haware, M.P., 1999. Maackiain in Cicer bijungum associated with resistance to Botrytis. Biochem. Syst. Ecol. 27, 761-767
  54. Turnbull, J.J., Nakajima, J.I., Welford, R.W.D., Yamazaki, M., Saito, K., Schofield, C.J., 2004. Mechanistic studies on three 2-Oxoglutarate-deendent oxygenases of flavonoid biosynthesis. J. Biol.
  55. Zhang, Z., Barlow, J.N., Baldwin, J.E., Schofield, C.J., 1997. Metal-Catalyzed Oxidation and Mutagenesis Studies on the Iron(II) Binding Site of 1-Aminocyclopropane-1-carboxylate Oxidase. Biochemistry 36, 15999-16007
  56. Schijlen, E.G.W.M., de Vos, C.H.R., van Tunen, A.J., Bovy, A.G., 2004. Modification of flavonoid biosynthesis in crop plants. Phytochemistry 65, 2631-2648
  57. Xu, F., Cheng, H., Cai, R., Li, L.L., Chang, J., Zhu, J., Zhang, F.X., Chen, L.J., Wang, Y., Cheng, S.H., Cheng, S.Y., 2008. Molecular cloning and function analysis of an anthocyanidin synthase gene from Ginkgo biloba and its expression in abiotic stress responses. Mol. Cells 26, 536-547
  58. Ryle, M. J., Hausinger, R. P., 2002. Non-heme iron oxygenases. Curr. Opin. Chem. Biol. 8, 193-201
  59. Yamakawa, T., Kato, S., Ishida, K., Kodama, T., Monoda, Y., 1983. Production of anthocyanins by Vitis cells in suspension culture. Agric. Biol. Chem. 47, 2185-2191
  60. Ranelletti, F.O., Maggiano, N., Serra, F.G., Ricci, R., Larocca, L.M., Lanza, P., Scambia, G., Fattorossi, A., Capelli, A., Piantelli, M., 2000. Quercetin inhibits p21-RAS expression in human colon cancer cell lines and in primary colorectal tumors. Int. J. Cancer 85, 438-445
  61. Xing, N., Chen, Y., Mitchell, S.H., Young, C.Y., 2001. Quercetin inhibits the expression and function of the androgen receptor in LNCaP prostate cancer cells. Carcinogenesis 22, 409-414
  62. Witte, S., Moco, S., Vervoort, J., Matern, U., Martens, S., 2009. Recombinant expression and functional characterisation of regiospecific flavonoid glucosyltransferases from Hieracium pilosella L. Planta 229, 1135-1146
  63. Schlaman, H.R.M., Okker, R.J.H., Lugtenberg, B.J.J., 1992. Regulation of nodulation gene expression by NodD in Rhizobia. J. Bacteriol 174, 5177-5182
  64. Wellmann, F., Matern, U., Lukačin, R., 2004. Significance of C-terminal sequence elements for Petunia flavanone 3β-hydroxylase activity. FEBS Letters 561, 149-154
  65. Staatsexamen nach AppO für Apotheker absolviert im Sommersemester 2005
  66. Staatsexamina: 1. Staatsexamen nach AppO für Apotheker absolviert im Sommersemester 2003
  67. Martin, C., Gerats, T., 1993. The control of pigment biosynthesis during petal development. Plant Cell 5, 1253-1264
  68. Prescott, A.G., Lloyd, M., 2000. The iron(II) and 2-oxocid-dependent dioxygenases and their role in metabolism. Nat. Prod. Rep. 17, 367-383
  69. Myllylä, R., Kuutti-Savolainen, E.-R., Kivirikko, K.I., 1978. The role of ascorbate in the prolyl hydroxylase reaction. Biochem. Biophys. Res. Commun. 83, 441
  70. Reuber, S., Bornman, J.F., Weisenböck, G., 1996. A flavonoid mutant of barlex exhibits increased sensitivity to UV-B radiatin in primary leaves. Plant Cell Environ. 19, 593-599
  71. Williams, C.A., Grayer, R.J., 2004. Anthocyanins and other flavonoids. Nat. Prod. Rep. 21, 539-573
  72. Towbin, H., Staehelin, T., Gordon, J., 1979. Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 76, 4350-4354
  73. Sutherland, O.R.W., Russell, G., Biggs, D.R., Lane, G.A., 1980. Insect feeding deterrent activity of phytoalexin isoflavonoids. Biochem. Syst. Ecol. 8, 73-75
  74. Welford, R.W.D., Kirkpatrick, J.M., McNeill, L.A., Puri, M., Oldham, N.J., Schofield, C.J., 2005. Incorporation of oxygen into the succinate co-product of iron(II) and 2-oxoglutarate dependent oxygenases from bacteria, plants and humans. FEBS Letters 579, 5170-5174
  75. Prescott, A.G., Stamford, N.P.J., Wheeler, G., Firmin, J.L., 2002. In vitro properties of a recombinant flavonol synthase from Arabidopsis thaliana. Phytochemistry 60, 589-593
  76. Schröter, H., Heiss, C., Spencer, J.P.E., Keen, C.L., Lupton, J.R., Schmitz, H.H., 2010. Recommending flavonols and procyanidins for cardiovascular health: Current knowledge and future needs. Mol. Aspects Med. 31, 546-557
  77. Nagai, T., Myoda, T., Nagashima, T., 2005. Antioxidative activities of water extract and ethanol extract from field horsetail (tsukushi) Equisetum arvense L. Food Chem. 91, 389-394
  78. Structure and Mechanism of Anthocyanidin Synthase from Arabidopsis thaliana. Structure 10, 93-103
  79. Middleton, E., Kandaswami Jr., C., Theoharides, T.C., 2000. The effects of plant flavonoids on mammalian cells: implications for inflammation, heart disease and cancer. Pharmacological Reviews 52, 673-751


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