Titel: | Erkennen von Proteinoberflächen durch ungewöhnliche Substrat-analoge Inhibitoren am Beispiel der cAMP-abhängigen Proteinkinase A |
Autor: | Müller, Janis |
Weitere Beteiligte: | Klebe, Gerhard (Prof. Dr.) |
Veröffentlicht: | 2017 |
URI: | https://archiv.ub.uni-marburg.de/diss/z2018/0044 |
URN: | urn:nbn:de:hebis:04-z2018-00447 |
DOI: | https://doi.org/10.17192/z2018.0044 |
DDC: | Biowissenschaften, Biologie |
Titel (trans.): | Recognition of protein surfaces by unusual substrate-analogue inhibitors on the cAMP-dependent protein kinase A |
Publikationsdatum: | 2018-01-08 |
Lizenz: | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0 |
Schlagwörter: |
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Peptidischer Ligand, Ribose, Boronsäure, Protein kinase, Substratanaloga, Peptide, boronic acid, substrat-analogue, Proteine, Proteinkinase, Ribose, Ligand, peptidic ligand, ribose, Selbst-Assemblierende Komplexe, self-assembly complexes |
Zusammenfassung:
Im Rahmen dieser Arbeit sollten innerhalb eines Kooperationsprojektes mit den
Arbeitsgruppen GEYER und DEHNEN aus Marburg und SCHREINER aus Gießen, nach
Maßgabe des LOEWE-SynChemBio-Projektes, mehrere Konzepte zur Entwicklung neuer
selektiver peptidischer Inhibitoren für Proteinkinasen entwickelt und mithilfe von
Bindungsassays, Proteinkristallisation und Röntgenstrukturanalyse verifiziert werden.
Im Rahmen dieses Projektes sollte versucht werden, Ribo-Aminosäuren innerhalb des peptidischen Liganden PKI einzuführen, um einen Ansatzpunkt für Reaktionen mit Boronsäuren zu erhalten. Anschließend sollten Derivate des literaturbekannten, hochaffinen Inhibitors Fasudil, der innerhalb der ATP-Bindetasche von Kinasen bindet, mit einer Phenylboronsäure-Gruppe synthetisiert werden. Die in Folge der Bindung der Fasudil-Derivate an die PKA in Richtung der Peptid-Bindetasche ausgerichtete Phenylboronsäure sollte analog wie in DMSO NMR-spektroskopisch durch Dr. ROMINA KIRSCHNER nachgewiesen, in Lösung mit der Ribose des peptidischen Liganden reagieren und somit beide Bindestellen verknüpfen.
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