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Titel:Validierung von Microarray-Genexpressionsdaten bei Neuroblastomen mittels quantitativer Real-Time PCR
Autor:Kartal, Ali
Weitere Beteiligte: Christiansen, Holger ( Prof. Dr.)
Veröffentlicht:2007
URI:https://archiv.ub.uni-marburg.de/diss/z2008/0006
URN: urn:nbn:de:hebis:04-z2008-00066
DOI: https://doi.org/10.17192/z2008.0006
DDC: Medizin
Titel (trans.):Validation of microarray gene expression data in neuroblastomas by quantitative real-time PCR
Publikationsdatum:2008-01-25
Lizenz:https://rightsstatements.org/vocab/InC-NC/1.0/

Dokument

Schlagwörter:
Real time quantitative PCR, Microarray, Neuroblastom, Microarray, Quantitative real-time PCR, Neuroblastoma

Zusammenfassung:
Das Neuroblastom ist der häufigste extrakranielle Tumor bei Kindern unter 5 Jahren und unter anderem durch seine klinische und biologische Heterogenität gekennzeichnet. Ein wichtiger prognostischer Parameter ist die genomische Amplifikation des MYCN-Protoonkogens. Zahlreiche Untersuchungen konnten zeigen, dass die MYCN Amplifikation mit fortgeschrittenen Tumorstadien, schneller Tumorprogression und einer insgesamt schlechten Prognose vergesellschaftet ist. In der vorliegenden Arbeit wurden die Microarray-Genexpressionsdaten von fünf ausgewählten Genen an MYCN amplifizierten und MYCN nicht amplifizierten Tumorproben mittels der quantitativen real-time PCR untersucht. Dabei konnten Expressionsmusterunterschiede in vier von fünf untersuchten Genen bestätigt werden. Ein weiterer Validierungsansatz in der vorliegenden Arbeit war, den Einfluss der MYCN Expression auf die Expression von hochregulierten Genen wie Aurora-A und TRAP1 mittels der Neuroblastomzelllinie SHEP Tet-21/N, in welcher der MYCN Promoter unter dem supprimierenden Einfluss von Tetrazyklin steht, zu untersuchen. Die Ergebnisse zeigen, dass die Expression der untersuchten Gene von der MYCN Induktion abhängig ist. Ferner widmet sich diese Arbeit der Fragestellung, ob in MYCN amplifizierten Tumorproben eine Amplifikation der Aurora-A spezifischen Region detektiert werden kann. Hierzu wurden MYCN amplifizierte und MYCN nicht amplifizierte Neuroblastomproben sowie Neuroblastomzelllinien mit dem Taqman Verfahren untersucht. Zusammenfassend konnte in unseren Experimenten keine höhergradige Aurora-A Amplifikation detektiert werden.


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