Arbeiten zur strukturellen Charakterisierung von Thioesterase-, Kondensations- und Epimerisierungsdomänen nichtribosomaler Peptidsynthetasen

Nichtribosomal synthetisierte Peptide stellen eine breite Klasse von Naturstoffen dar und besitzen meist pharmakologisch nützliche Eigenschaften. Diese von Bakterien und Pilzen produzierten, niedermolekularen Peptidverbindungen enthalten meist modifizierte Reste, zum Teil Aryl- und Fettsäuren und s...

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Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser: Samel, Stefan Andreas
Beteiligte: Essen, L.-O. (Prof. Dr.) (BetreuerIn (Doktorarbeit))
Format: Dissertation
Sprache:Deutsch
Veröffentlicht: Philipps-Universität Marburg 2009
Chemie
Schlagworte:
Online Zugang:PDF-Volltext
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9. Abbildung 8.2: Erzeugung von Struktur-Suchmodellen mit unterschiedlichen Subdomänenanordnungen Die Abbildung zeigt jeweils die N-terminale Subdomäne der auf die C-terminale Subdomäne überlagerten Strukturen. (A) Unterschiedliche Orientierung der N-terminalen Subdomänen in den Strukturen von PCP-C, SrfA-C und VibH. Die Anordnung der Subdomänen in SrfA-C und VibH sind gegenüber PCP-C in entgegengesetzten Richtungen verdreht. (B) Überlagerung der drei N-terminalen Subdomänen in einem Bild. (C) In silico generierte, theoretische Zwischen- stufen von relativen Subdomänen-Anordnungen in NRPS-Kondensationsdomänen. Der Übersichtlichkeit halber sind insgesamt nur 7 Modelle abgebildet. Farbgebung der Modelle gemäß Farbverlauf-Legende.


10. Berechnete Matthews-Koeffizienten für die Kristallform von TycB3-E


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15. Größe der Einheitszelle, ist das Ergebnis nicht eindeutig. Der Bereich der möglichen Molekülanzahl reicht von 6 bis 12. Wie aus der Tabelle hervorgeht, ist es am wahrscheinlichsten, dass 9-10 Moleküle in der asymmetrischen Einheitszelle vorliegen.


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